זרעי פשתן מכילים רכיבים תזונתיים חשובים לשמירה על הבריאות. הם מהווים מקור צמחי טוב לחומצות שומן חיוניות מסוג אומגה 3 ולכן עשויים לסיוע בשמירה על בריאות הלב וכלי הדם, איזון מערכת העצבים, הפחתת כולסטרול ועוד. זרעי פשתן מכילים כמויות גבוהות של סיבים תזונתיים מה שתורם רבות לשיפור העיכול ולטיפול במצבי עצירות, גסטריטיס, צרבות ועוד. זרעי פשתן מסייעים באיזון רמות סוכר בדם ועשויים לסייע עם סוכרת סוג 2 ומצבים מטבוליים קשורים.